服务器配置

Documentation

服务器配置

基本情况

下面列出服务器放置的位置和主要用途，方便读者区分。当然主要用途之外也可以有“次要用途”，只要不影响他人。

服务器	地址（物理意义上）	操作系统	主要用途
厦大超算（jykang）	我也不知道好像在嘉庚三地下室反正这个肯定丢不了	Linux CentOS	VASP（CPU）
srv1	物机大楼 351 隔间内机架上很吵的那四台就是	Linux NixOS	VASP（CPU）
srv1 （Windows）	虚拟机对应宿主为 srv1-node2 即从上往下数第三个节点	Windows	FDTD Solutions
xmupc1	物机大楼457我桌子右边	Linux NixOS	VASP（GPU）
xmupc2	物机大楼457我桌子右边	Linux NixOS	VASP（GPU）

软件

待补充（VASP 打了哪些补丁，还有哪些计算软件等）。

连接协议和参数

以下总结了各个服务器支持的连接协议和对应的参数，留空即表明该服务器不支持该协议。如果不知道如何使用这些参数，参考连接到服务器。

服务器	用户名	SSH 地址	SSH 端口	RDP 地址	SMB 地址¹
厦大超算（jykang）	`jykang`	`hpc.xmu.edu.cn`²	`22`
srv1	`GROUPIII-n`	`srv1.chn.moe`	`22`	`srv1.chn.moe:6211`³	`srv1.chn.moe`
srv1（Windows）	`GROUPIII-n`	`srv1.chn.moe`	`6144`	`srv1.chn.moe`
xmupc1	姓名首字母（例如 `chn`）	`xmupc1.chn.moe`	`6007`	`xmupc1.chn.moe`³	`xmupc1.chn.moe`
xmupc2	姓名首字母（例如 `chn`）	`xmupc2.chn.moe`	`6394`	`xmupc2.chn.moe:3390`³

硬件配置

以下表格总结了各个服务器的硬件配置。

现在（2024 年）最好的笔记本 CPU（R9-7945HX）性能约为 125 GFLOPS，整机大约七千可以买到，可以据此估计各个服务器的 CPU/GPU 性能。

这里仅列出 jykang 有权限使用的节点。信息采集于 2024 年 10 月 21 日，可能有变化。

节点组	单节点CPU	单节点理论性能（GFLOPS）	单节点内存
`cnodes`	双路 Intel E5-2690 共 16 核 32 线程限制使用 20 线程	29	`c00{1..9}`: 约 60 GB `c0{19..44}`: 约 30 GB `c0{45..48}`: 251.7 GB
`normal_1day` `normal_1week`	双路 Intel E5-2680 v4 共 28 核	93	124.9 GB
`b_node`	双路 Intel 5318Y 共 48 核	167	251.3 GB
`charge_s_normal` `hd_sd530`	双路 Intel 6126 共 24 核	79	`charge_s_normal`: 约 180 GB `hd0{01..27}`: 125.2 GB `hd028`: 93.7 GB
`hd_sd530_6226R`	双路 Intel 6226R 共 32 核	129	188.2 GB

此集群包含了四个节点。其中第一个节点（srv1-node0）的性能较好，推荐优先使用；剩下的三个节点性能相对较差。用于存储计算数据的硬盘大小为 1 TB，使用 btrfs，实际可存储数据大约 2.5 TB。

节点主机名（Slurm 中的节点名）	内存	CPU	CPU 理论性能（GFLOPS）
srv1-node0 （n0）	128 GB	四路 Intel Gold 6230 共 80 核 160 线程	250
srv1-node1 （n1）	32 GB	四路 Intel E7-4809v4 共 32 核 64 线程	146
srv1-node2 （n2）	64 GB	四路 Intel E7-4809v4 共 32 核 64 线程	146
srv1-node3 （n3）	40 GB	四路 Intel E7-4809v4 共 32 核 64 线程	146

注：谨慎使用第三个节点（srv1-node2）做计算。详见下方的说明。

谨慎使用第三个节点的原因

按照吴志明老师的要求，此节点还安装了一个 Windows 虚拟机用于 FDTD Solutions（即srv1（Windows））。同时使用 Windows 虚拟机和宿主机做计算会严重影响性能，占用内存过高还有可能会导致节点崩溃，你的任务就白算了（倒是也没有什么更严重后果）。如果你不知道这段时间内有没有人在使用 Windows 虚拟机，建议干脆不要使用这个节点。

用于存储计算数据的硬盘空间约 500 GB。

内存	CPU	CPU理论性能（GFLOPS）
128 GB	四路 Intel E7-4809v4 共 32 核 32 线程	146

对于大多数任务，推荐使用 GPU 进行计算，因为算得快；对于需要较多内存的任务，因为 GPU 的显存不够用，推荐使用 CPU。

xmupc1 用于存储计算数据的硬盘大小为 2 TB，使用 btrfs，实际可存储数据大约 5 TB。 xmupc2 用于存储计算数据的硬盘大小为 18 TB，使用 btrfs，实际可存储数据大约 40 TB。

主机	设备	理论性能（GFLOPS，双精度/单精度）	内存/显存
xmupc1	CPU: AMD R9-5950X 16 核 32 线程	100/100	96 GB
xmupc1	GPU: NVIDIA 4090	1290/82580	24 GB
xmupc1	GPU: NVIDIA 3090	556/35580	24 GB
xmupc1	GPU: NVIDIA P5000	194/6197	16 GB
xmupc2	CPU: 双路 Intel Gold 6152 共 44 核 88 线程	136/136	256 GB
xmupc2	GPU: NVIDIA 4090	1290/82580	24 GB
	GPU: NVIDIA 2080 Ti （买了没装）	421/13448	12 GB
	GPU: NVIDIA H100 （未付款，期待发货）	25600/51200	80 GB

注：VASP 使用双精度浮点（即双精度的 GFLOPS 更能估计 VASP 的实际性能）。一些其它的软件可能使用单精度浮点（例如 LAMMPS）也可能使用双精度浮点。深度学习、游戏渲染时，一般使用单精度或者半精度浮点。

队列

一些服务器包含多个队列。

信息采集于 2024 年 10 月 21 日，可能有变化。

队列	时间限制	节点组	节点
`normal`（默认）	14 天	`cnodes`	`c00{1..9}` `c0{19..48}` 以下除外：`c022`
`normal_1day`	1 天	`normal_1day`	`nxt00{1..9}` `nxt0{41..67}` 以下除外：`nxt043`
`normal_1week`	7 天	`normal_1week`	`nxt0{10..40}` 以下除外：`nxt015`
`normal_2week`	14 天	`b_node`	`b0{01..14}`
`normal_1day_new`	1 天	`charge_s_normal`	`s0{06..18}`
`ocean_530_1day`	1 天	`hd_sd530`	`hd0{01..28}`
`ocean6226R_1day`	1 天	`hd_sd530_6226R`	`hd0{29..48}`

队列	包含节点
`localhost`（默认）	`n0`
`old`	`n1` `n3`
`fdtd`	`n2`
`all`	`n[0-3]`

SMB 协议使用与 RDP 或 SSH 不同的认证机制，与 SSH 和 RDP 不共用密码，使用前需要先联系我设置一个。此外 SMB 协议安全性可能不及其它两者。 ↩︎
使用厦大超算（jykang）时，必须开启 SSH agent forwarding，详见连接 VASP 服务器，开启 SSH 代理转发或使用 OpenSSH。 ↩︎
使用 RDP 协议连接到 Linux 服务器时，需要手动设置连接类型，详见：RDP 设置连接类型。当使用 Linux 系统连接到 Linux 服务器时，推荐使用 SSH X11 forwarding 代替远程桌面。详见：使用 SSH X11 forwarding。 ↩︎ ↩︎ ↩︎

快速开始厦大超算（jykang）使用统计